Розвиток інформаційних технологій і систем у ЧІТІ (нині ЧДТУ) розпочався у 1988 р. з відкриттям спеціальності 0608 “Електронні обчислювальні машини” під керівництвом доцента Г.Т. Олійника, а потім професора Ю.О. Кочкарьова. Після цього змінювалися назви і шифри спеціальностей: 22.01 “ЕОМ.Комп’ютерні системи та мережі”, надалі 22.01 “Інтелектуальні обчислювальні машини, мережі та системи”, а нині 7.091501 “Комп’ютерні системи та мережі”. Зміна шифрів і назв спеціальності практично не змінила базового складу спеціальних дисциплін, а відобразила лише зміну поетапних поглядів на класифікацію напрямів підготовки фахівців.    Вимоги ринку праці в 90-ті рр. ХХ ст. у Черкаському регіоні настійно потребували більш високої спеціалізації випускників у галузі програмного забезпечення обчислювальних та автоматизованих систем і в прикладних галузях використання обчислювальної техніки, тобто в галузі створення і використання сучасних інформаційних технологій. Це стало передумовою створення на початку 1998/1999 навчального року на базі кафедри обчислювальної техніки факультету інформаційних технологій і систем (ФІТІС).
  З 1998 р. деканом факультету інформаційних технологій та систем призначено доктора технічних наук, професора, академіка Міжнародної академії комп‘ютерних наук та систем, дійсного члена Нью-Йоркської академії наук, відомого вченого у галузі автоматики і телемеханіки, завідувача кафедри системного аналізу та методів прийняття рішень Тимченка Анатолія Анастасійовича. 
  Під керівництвом А.А. Тимченка захистилося близько 35 кандидатів та 7 докторів наук. Створено Черкаське науково-виробниче відділення МАКНС, відділ системних інформаційних технологій Інституту кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України, працює об’єднаний семінар з проблеми «Кібернетика» та факультетський семінар з інформаційних технологій. 
  На сьогоднішній день факультет складається з шести кафедр: статистики та прикладної математики, комп’ютерних наук та системного аналізу; інформаційних технологій проектування; програмного забезпечення автоматизованих систем; інформаційної безпеки та комп’ютерної інженерії, робототехніки та спеціалізованих комп’ютерних систем.
Факультет має 8 спеціалізованих лабораторій, обладнаних сучасними комп’ютерами, мережним обладнанням та іншими спеціалізованими пристроями і лабораторним приладдям. Більш ніж 80 % професорсько-викладацького складу мають науковий ступінь доктора або кандидата технічних наук. 
 Високий професійний рівень професорсько-викладацького складу факультету дає можливість готувати висококваліфікованих спеціалістів, розробляти і використовувати нові інформаційні технології, проектувати автоматизовані системи управління підприємствами тощо. Випускники факультету вивчають теоретичні й практичні основи автоматизованих систем обробки інформації та управління на базі швидкісних обчислювальних мереж та систем. Особливий внесок випускники ФІТІС вносять у розвиток нових інформаційних систем захисту інформації тощо. Студенти вивчають сучасні комп’ютерні технології та методи, включаючи дистанційну освіту.
    Викладачі факультету постійно розробляють нове навчально-методичне забезпечення з кожної дисципліни, що сприяє швидкому впровадженню новітніх знань у навчальний процес. Спеціалісти факультету співробітничають з українськими та зарубіжними партнерами. Ними здійснюються постійні наукові контакти з Інститутом кібернетики НАН України (м. Київ), міжнародним науково-учбовим центром ЮНЕСКО, національним технічним університетом “КПІ” (м. Київ), Національним університетом будівництва і архітектури (м. Київ), Університетом техніки, науки та культури (м. Лейпциг), технічним університетом (гірничою академією), (м. Фрайберг, Германія) та ін.
   Колектив факультету головним завданням вважає підготовку студентів на сучасному технічному рівні відповідно до концепції інтелектуальних інформаційних систем, підготовку молодого покоління викладацького складу і формування в них почуття гордості за причетність до великої ідеї інтелектуалізації суспільства. При формуванні складу викладачів окремих кафедр на факультеті колектив спирається на загальнофакультетські завдання підготовки фахівців.
 Можна виділити головні напрямки основної спеціалізації викладачів, які підтримують у своїй навчальній і науковій праці устояні наукові напрямки: архітектури і структури ЕОМ, сучасних систем і мереж; конструкторсько-технологічний напрямок створення ЕОМ; програмні засоби і комплекси комп’ютеризації; новітні інформаційні технології та їх використання; засоби телекомунікації та Internet. 
 Нині обчислювальна техніка як основний технічний засіб, що забезпечує реалізацію інформаційних технологій у різних галузях науки, техніки і виробництва, поряд з технологіями матеріального та енергетичного виробництв міцно узвичаїлася у повсякденному використанні практично кожної людини і суспільства в цілому. Настає ера суцільної інформатизації, коли людина здатна впровадити застосування обчислювальної техніки в усі елементи навколишнього світу, у тому числі в себе, так ще на самому нижньому, практично клітинному, рівні. Так, наприклад, в оповіданнях фантастів мікроскопічні діагностичні комп’ютерні структури вводяться у кров людини і, подорожуючи по всіх куточках організму, передають інформацію про її стан. І це не таке вже далеке майбутнє. Активно розробляється тематика віртуальних підприємств, навчальних закладів, бібліотек, створюються засоби типу “електронний будинок”, нейронні мережі тощо. Реалізація практично будь-яких проектів інформатизації можлива лише за наявності висококласних фахівців, які, звичайно ж, виходять з вищих навчальних закладів. ФІТІС ЧДТУ саме й орієнтований на комплексну підготовку студентів у галузі засобів сучасної та перспективної обчислювальної техніки і її використання за найбільш важливими напрямками.
  На основі досвіду провідних університетів України і розвинених країн світу, колектив ФІТІС на чолі з професором А.А. Тимченком ініціював у 2009-2010 навчальному році створення на базі факультету, що має багаті наукові традиції і висококваліфікований професорсько-викладацький склад, Інституту системних інформаційних досліджень (ІСІД). Це обумовлено тим, що подальший розвиток вищої школи в Україні повинен здійснюватися на основі підняття ролі університетської науки на всіх її рівнях. Тому одним з головних завдань інституту (факультету) є організація фундаментальних і прикладних наукових досліджень із пріоритетних наукових напрямів, новітніх технологій та їх упровадження у навчально-виховний процес, як основи підготовки майбутніх фахівців відповідного напряму підготовки.
   Гарною напрямком розвитку ФІТІС є вступ кращих його випускників до аспірантури (третій освітньо-науковий рівень), яка ефективно і результативно працює практично на всіх кафедрах. 
  Традиції і розвиток факультету плідно продовжив на посаді декана Євгеній Володимирович Ланських, ініціювавши впровадження у навчання сертифікаційних курсів  провідних світових ІТ-гігантів. Таким чином студенти можуть отримати крім знань ще документ, що підтверджує їх навички.
    Активною розбудовою факультету та впровадженням сучасних тенденцій ІТ в підготовку фахівців відзначилась декан факультету Трегубенко Ірина Борисівна, яка очолювала факультет із 2016 по 2021 роки. Під її керівництвом на факультеті також активно розвивалися наукові школи, студентські наукові гуртки, проводилися олімпіади та хакатони.